| Mã CAT | Sản phẩm | Kích thước | Giá |
|---|---|---|---|
| PB20.32-01 | Clara® HRM Mix | 100 x 20 μL Reactions | Contact us |
| PB20.32-05 | Clara® HRM Mix | 500 x 20 μL Reactions | Contact us |
| PB20.32-20 | Clara® HRM Mix | 2000 x 20 μL Reactions | Contact us |
Để xem giá của bạn, vui lòng đăng nhập hoặc đăng ký với mã báo giá của bạn.
Thông tin thêm
HRM là gì?
Phân tích đường cong Nắng cao độ (HRM) là một kỹ thuật mạnh mẽ được sử dụng để phân tích các biến thể, polymorphisms và sự khác biệt về biểu tiến hóa trong mẫu DNA sợi đôi. Phương pháp này dựa vào việc phân tích sự biến đổi sau khuếch đại của các mục tiêu qPCR kết hợp với các phẩm màu DNA thế hệ thứ ba có tác dụng ức chế polymerase giảm (ví dụ: SYBR Green 2, EvaGreen). Phân tích HRM tận dụng sự khác biệt trong hình dạng đường cong tan chảy và nhiệt độ tan chảy của DNA để phân biệt các biến thể trình tự giữa các mẫu.
Thông thường, trong một lần chạy phân tích đường cong tan chảy sau một qPCR dựa trên phẩm màu chuẩn, dữ liệu phát xạ được thu thập mỗi 0.2-0.5 °C, trong khi trong phân tích HRM, dữ liệu được thu thập với mật độ cao hơn nhiều, mỗi 0.1 °C, dẫn đến độ phân giải của đường cong tan chảy cao hơn nhiều. Do đó, ngay cả những khác biệt nhỏ (xuống đến các đột biến điểm đơn, SNPs, và methyl hóa base-pair), trong các trình tự mục tiêu được ghi nhận như là những đường cong tan chảy đã chuyển. HRM do đó cung cấp một giải pháp hiệu quả hơn, rẻ hơn cho phát hiện SNP, phân biệt ale và phát hiện biến thể mục tiêu.
Các biến đổi trình tự có thể phát hiện
Clara® HRM Mix có thể phân biệt tất cả các loại SNP. Những loại này bao gồm:
- Loại I: C đến T và G đến A
- Loại II: C đến A và G đến T
- Loại III: C đến G
- Loại IV: A đến T
Thêm vào đó, hỗn hợp này cũng có thể được sử dụng để định lượng methyl hóa CpG trong một trình tự mục tiêu. Trong trường hợp này, DNA có thể methyl hóa sẽ được xử lý bằng bisulfite trước khi chạy qPCR HRM với các mồi nhắm vào các vùng chứa CpG. Trong quá trình xử lý bằng bisulfite, tất cả các resíduos cytosine không methyl hóa sẽ được khử amin và do đó được chuyển đổi thành residuos uracil, trong khi tất cả các residuos cytosine đã methyl hóa sẽ không thay đổi. Phân tích HRM trên mẫu đã qua xử lý bisulfite so với mẫu điều khiển tương ứng không qua xử lý cho phép ước lượng tỷ lệ phần trăm methyl hóa cytosine của mục tiêu, vì các trình tự đã methyl hóa sẽ có tỷ lệ CG cao hơn so với các mục tiêu không methyl hóa sau khi xử lý bisulfite.
Các thiết bị tương thích HRM
Chạy các thí nghiệm HRM yêu cầu các thiết bị tương thích. Không phải tất cả các thiết bị PCR thời gian thực đều có khả năng đạt được mức tăng nhiệt độ cần thiết để tiến hành phân tích HRM. Chúng tôi khuyên bạn nên sử dụng một trong các máy qPCR thermocyclers được liệt kê từ các nhà sản xuất sau:
- Applied Biosystems: 7900, 7900HT, 7900HT FAST, StepOne, StepOne Plus, 7500, 7500 FAST, Viia7
- Bio-Rad: CFX96, CFX384
- BMS: Mic
- Eppendorf: Mastercycler ep realplex, Mastercycler realplex 2S
- Illumina: Eco
- Qiagen/Corbett: 6000, Q
- Roche Applied Science: Lightcycler 480, Lightcycler Nano
Các thiết bị khác không nằm trong danh sách cũng phù hợp cho phân tích HRM sử dụng Clara® HRM Mix. Vui lòng sử dụng Công cụ Chọn lựa qPCR của chúng tôi, kiểm tra hướng dẫn sản phẩm của thiết bị của bạn, hoặc liên hệ với chúng tôi qua technical@pcrbio.com để nhận được sự hỗ trợ trong việc chọn lọc một thiết bị phù hợp.
Ứng dụng
- Phân loại SNP
- Quét gen
- Phân tích methyl hóa CpG
Thông số kỹ thuật
Clara® HRM Mix
| Thành phần | 100 phản ứng | 500 phản ứng | 2000 phản ứng | |
|---|---|---|---|---|
| 2x Clara HRM Mix | 1 x 1 mL | 5 x 1 mL | 20 x 1 mL |
Clara® HRM Mix
| Thành phần | 100 phản ứng | 500 phản ứng | 2000 phản ứng | |
|---|---|---|---|---|
| 2x Clara HRM Mix | 1 x 1 mL | 5 x 1 mL | 20 x 1 mL |
Thông tin phản ứng
| Thể tích phản ứng | Kho lưu trữ | |||
|---|---|---|---|---|
| 20 μL |
Khi nhận hàng, sản phẩm nên được lưu trữ giữa -30 °C và -20 °C. Nếu được lưu trữ đúng cách, bộ sản phẩm sẽ giữ được hoạt tính đầy đủ cho đến ngày hết hạn được chỉ định. |
Sự tương thích với thiết bị
Sản phẩm này tương thích với tất cả các thiết bị qPCR tiêu chuẩn và nhanh có khả năng Nóng chảy cao. Sử dụng Công cụ Lựa chọn qPCR của chúng tôi để tìm ra các thiết bị có thể được sử dụng.
Tài liệu
Tờ rơi sản phẩm
Hướng dẫn sử dụng
Bảng dữ liệu an toàn
Ghi chú ứng dụng
Câu hỏi thường gặp (FAQs)
Có thể thực hiện đa mặt với Clara® HRM Mix không?
Có
Làm thế nào để loại bỏ các sản phẩm không xác định trong phân tích HRM?
Độ đặc hiệu có thể được tăng cường bằng cách tăng nhiệt độ hồi đáp hoặc thiết kế lại các mồi. Đảm bảo rằng không có DNA ô nhiễm vì điều này có thể gây ra tín hiệu không xác định. Khi thực hiện các phản ứng ban đầu, chúng tôi luôn khuyên bạn nên chạy gradient. Chúng tôi cũng khuyên bạn nên tiến hành phân tích gel agarose, để hoàn toàn xử lý sự cố và xác định các sản phẩm.
Những điều cần lưu ý chung để đạt được kết quả chất lượng cao với Clara® HRM Mix là gì?
- Đảm bảo rằng chất lượng mẫu DNA là tuyệt vời, nghĩa là DNA phải tinh khiết và không có bất kỳ chất ức chế nào vì điều này có thể ảnh hưởng đến quá trình nhiệt độ nóng chảy. Cũng cần có đủ lượng DNA trong mẫu.
- Theo dõi các biện pháp phòng ngừa thông thường khi chuẩn bị các phản ứng qPCR, ví dụ, lắp ráp trên đá, pipet chính xác, niêm phong tấm qPCR đúng cách và đảm bảo rằng tất cả các giếng đã được niêm phong sau khi chạy, quay mẫu xuống để loại bỏ bọt khí và làm việc sạch sẽ.
- Các sản phẩm khuếch đại của bạn nên nằm trong khoảng từ 80 – 200 bp. Sự biến đổi một base sẽ ảnh hưởng đến nhiệt độ nóng chảy của một chuỗi ngắn nhiều hơn một chuỗi dài. Các đoạn lớn hơn có thể được phân tích nhưng độ phân giải sẽ bị suy giảm. Ngược lại, các đoạn quá ngắn sẽ có độ phát quang thấp và do đó tỷ lệ tín hiệu/tiếng ồn không thuận lợi.
- Đảm bảo rằng các đối chứng âm và dương của bạn còn nguyên vẹn, không bị ô nhiễm và được xử lý/tinh chế theo cách giống như mẫu của bạn để đảm bảo tính nhất quán.
- Đảm bảo rằng phản ứng của bạn đạt đến giai đoạn ổn định trong mỗi trường hợp. Điều này sẽ đảm bảo độ sáng phát quang bắt đầu giống nhau cho toàn bộ tấm. Hãy nhớ rằng nồng độ khác nhau của các sản phẩm sẽ tan chảy hơi khác nhau.
- Thu thập đủ điểm dữ liệu xung quanh nhiệt độ nóng chảy của các sản phẩm khuếch đại của bạn.
- Xem xét các biểu đồ khuếch đại của bạn. Các biểu đồ khuếch đại kém cho thấy các vấn đề trong qPCR và chắc chắn sẽ dẫn đến hành vi nóng chảy kém.
Clara® HRM Mix bao gồm những gì?
Clara® HRM Mix là một hỗn hợp đã được chuẩn bị sẵn. Bạn chỉ cần thêm các mồi, DNA mẫu và nước cấp PCR trong quá trình thiết lập phản ứng.
Chiều dài của sản phẩm khuếch đại nên là bao nhiêu?
Để khuếch đại hiệu quả dưới điều kiện chu trình nhanh, chúng tôi khuyên bạn nên chiều dài sản phẩm khuếch đại từ 80bp đến 200bp. Với tất cả các loại hỗn hợp của nhà sản xuất, chiều dài sản phẩm khuếch đại ngắn hơn sẽ giúp phản ứng có thể được chu trình nhanh hơn. Chiều dài sản phẩm khuếch đại không nên vượt quá 400bp. Các mồi nên có nhiệt độ nóng chảy dự đoán khoảng 60°C, sử dụng cài đặt mặc định của Primer 3 (http://frodo.wi.mit.edu/primer3/).
Clara® HRM Mix tương thích với các thiết bị nào?
- Applied Biosystems: 7900, 7900HT, 7900HT FAST, StepOne, StepOne Plus, 7500, 7500 FAST, Viia7
- Bio-Rad: CFX96, CFX384
- BMS: Mic
- Eppendorf: Mastercycler ep realplex, Mastercycler realplex 2S
- Illumina: Eco
- Qiagen/Corbett: 6000, Q
- Roche Applied Science: Lightcycler 480, Lightcycler Nano
Tại sao lại quan sát được các kết quả không đạt yêu cầu hoặc khác biệt khi so sánh Clara® HRM Mix với một hỗn hợp của đối thủ?
Các hỗn hợp HRM từ các nhà sản xuất khác nhau rất khác nhau về độ mạnh ion và thành phần tăng cường. Điều kiện chu trình có thể làm việc cho một hỗn hợp nhưng có thể không đạt yêu cầu cho hỗn hợp khác và do đó một chương trình chu trình mà làm việc với một hỗn hợp không thể được áp dụng cho hỗn hợp khác mà không cần tối ưu hóa. Chu trình có thể được tối ưu hóa bằng cách chạy gradient cho mỗi sản phẩm khuếch đại bất kể nhiệt độ hồi đáp đã tính toán hoặc lý thuyết.
Nếu tất cả những điều trên đã được áp dụng mà kết quả vẫn không đạt yêu cầu, vui lòng gửi email đến technical@pcrbio.com và bao gồm thông tin sau:
- Kích thước sản phẩm khuếch đại
- Cài đặt phản ứng
- Điều kiện chu trình
- Hình chụp màn hình của các dấu vết khuếch đại và vệ sinh nóng chảy
Xem thêm